Bourne herido y perseguido por la policía, busca sanarse al incursionar en una clínica! Tras zafar de la policía, decide ir en búsqueda del hermano de Marie, para contarle sobre su muerte. En el camino, Bourne lee un artículo que hablaba sobre él y decide encontrarse con el periodista. Éste (Simon Ross), se encuentra investigando la operación Black Briar, relacionada con el proyecto Treadstone.
Bourne busca la verdad sobre su pasado, desea conocer cual es la fuente de Ross y mientras tanto la CIA que estaba persiguiendo al periodista, desea también acabar con Bourne y descubrir cual es la fuente de información para enterrar toda la verdad.